Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms