Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms