Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms