Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR53Q7Z5U6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR53Q7Z5U6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms