Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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