Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SNCBQ16143 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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SNCBQ16143 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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