Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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