Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX5P78411 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX5P78411 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX5P78411 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX5P78411 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX5P78411 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX5P78411 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX5P78411 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX5P78411 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX5P78411 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms