Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK1A1P48729 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK1A1P48729 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms