Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL3P36405 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL3P36405 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL3P36405 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL3P36405 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL3P36405 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL3P36405 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL3P36405 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms