Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRAP19793 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRAP19793 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRAP19793 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRAP19793 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RXRAP19793 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RXRAP19793 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RXRAP19793 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RXRAP19793 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRAP19793 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRAP19793 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRAP19793 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRAP19793 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRAP19793 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRAP19793 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRAP19793 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRAP19793 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRAP19793 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRAP19793 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRAP19793 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRAP19793 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms