Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP2P13473 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms