Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM10L2BP0DMW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2BP0DMW5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms