Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL1A2P08123 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL1A2P08123 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL1A2P08123 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL1A2P08123 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL1A2P08123 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms