Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms