Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF2Q9Y6D5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms