Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms