Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms