Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms