Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms