Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms