Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms