Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms