Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms