Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC9Q6ZRR7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC9Q6ZRR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms