Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF613Q6PF04 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF613Q6PF04 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF613Q6PF04 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF613Q6PF04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF613Q6PF04 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms