Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms