Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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