Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS1Q14651 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLS1Q14651 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS1Q14651 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms