Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms