RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336576.9

DNAJB2-201, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DNAJB2, Length 3,176 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB2-201ENST00000336576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.42■■■■□ 3.74
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DNAJB2-201ENST00000336576 ABCC9O60706 1549 aa31.91■■■□□ 2.7
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DNAJB2-201ENST00000336576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.74■■■□□ 2.67
DNAJB2-201ENST00000336576 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.42■■■□□ 2.62
DNAJB2-201ENST00000336576 NACADO15069 1562 aa31.28■■■□□ 2.6
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DNAJB2-201ENST00000336576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.04■■■□□ 2.56
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DNAJB2-201ENST00000336576 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.71■■■□□ 2.35
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DNAJB2-201ENST00000336576 HRCP23327 699 aa29.27■■■□□ 2.28
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DNAJB2-201ENST00000336576 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.22■■■□□ 2.27
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DNAJB2-201ENST00000336576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
DNAJB2-201ENST00000336576 SMARCA2P51531 1590 aa29.06■■■□□ 2.24
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DNAJB2-201ENST00000336576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.88■■■□□ 2.21
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DNAJB2-201ENST00000336576 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.6■■■□□ 2.17
DNAJB2-201ENST00000336576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.39■■■□□ 2.14
DNAJB2-201ENST00000336576 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
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DNAJB2-201ENST00000336576 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.14■■■□□ 2.1
DNAJB2-201ENST00000336576 TRIM41Q8WV44 630 aa28.14■■■□□ 2.1
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DNAJB2-201ENST00000336576 NESP48681 1621 aa28■■■□□ 2.07
DNAJB2-201ENST00000336576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
DNAJB2-201ENST00000336576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.92■■■□□ 2.06
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DNAJB2-201ENST00000336576 SYNJ1O43426 1573 aa27.91■■■□□ 2.06
DNAJB2-201ENST00000336576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.83■■■□□ 2.05
DNAJB2-201ENST00000336576 TOP2BQ02880 1626 aa27.78■■■□□ 2.04
DNAJB2-201ENST00000336576 CUX1P39880 1505 aa27.78■■■□□ 2.04
DNAJB2-201ENST00000336576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.75■■■□□ 2.03
DNAJB2-201ENST00000336576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.72■■■□□ 2.03
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DNAJB2-201ENST00000336576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.56■■■□□ 2
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DNAJB2-201ENST00000336576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.47■■□□□ 1.99
DNAJB2-201ENST00000336576 EEA1Q15075 1411 aa27.42■■□□□ 1.98
DNAJB2-201ENST00000336576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
DNAJB2-201ENST00000336576 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.36■■□□□ 1.97
DNAJB2-201ENST00000336576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.35■■□□□ 1.97
DNAJB2-201ENST00000336576 ERCC6Q03468 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
DNAJB2-201ENST00000336576 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
DNAJB2-201ENST00000336576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.31■■□□□ 1.96
DNAJB2-201ENST00000336576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.29■■□□□ 1.96
DNAJB2-201ENST00000336576 KIF27Q86VH2 1401 aa27.26■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 CUX2O14529 1486 aa27.25■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 WDR62O43379 1518 aa27.25■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.23■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 MYT1Q01538 1121 aa27.21■■□□□ 1.95
DNAJB2-201ENST00000336576 WDR97A6NE52 1622 aa27.17■■□□□ 1.94
DNAJB2-201ENST00000336576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
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DNAJB2-201ENST00000336576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.05■■□□□ 1.92
DNAJB2-201ENST00000336576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
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DNAJB2-201ENST00000336576 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.02■■□□□ 1.92
DNAJB2-201ENST00000336576 IFT140Q96RY7 1462 aa27■■□□□ 1.91
DNAJB2-201ENST00000336576 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.97■■□□□ 1.91
DNAJB2-201ENST00000336576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
DNAJB2-201ENST00000336576 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.96■■□□□ 1.91
DNAJB2-201ENST00000336576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
DNAJB2-201ENST00000336576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
DNAJB2-201ENST00000336576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.92■■□□□ 1.9
DNAJB2-201ENST00000336576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
DNAJB2-201ENST00000336576 CUL7Q14999 1698 aa26.84■■□□□ 1.89
DNAJB2-201ENST00000336576 PBRM1Q86U86 1689 aa26.82■■□□□ 1.88
DNAJB2-201ENST00000336576 CEP162Q5TB80 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
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