Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC5P28715 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms