Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms