Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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