Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms