Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMBP3BA6NNM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms