Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms