Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRBV30A0A0K0K1B3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV30A0A0K0K1B3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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