Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms