Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES2Q9Y543 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HES2Q9Y543 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms