Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETD1BQ9UPS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms