Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms