Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM7Q9UK45 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms