Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVK13-1Q9NX77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVK13-1Q9NX77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms