Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms