Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCIQ9NVI1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCIQ9NVI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCIQ9NVI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms