Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C19orf12Q9NSK7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C19orf12Q9NSK7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms