Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNHG12Q9BXW3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms