Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS2Q99743 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS2Q99743 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms