Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGBD1Q96JS3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms